Un sola instalación de Express Accounts puede administrar varias empresas. Cada empresa se ejecuta como si fuera una instalación completamente diferente de las otras empresas que se guardan en Express Accounts. Cada una de las configuraciones pueden ser cambiadas para cada una de las empresas. Cada empresa tiene sus propios clientes, artículos, pagos y, por supuesto, facturas.

Para añadir una empresa, desde el menú 'archivo' seleccione 'factura' -> Múltiples empresas. Luego presione el botón 'añadir empresa nueva'. Después que presiona añadir, se ejecuta el asistente para inicio rápido.

Para eliminar una empresa, desde el menú 'archivo' seleccione 'factura' -> múltiples empresas. Resalte la empresa que desea eliminar y presione el botón 'eliminar empresa'.