Doxillionのファイル一覧画面で選択したPDFsはツールバーの「PDFを圧縮」ボタンをクリックするか、「ツール」メニューから「PDFを圧縮...」を選択、またはファイルを右クリックして「PDFを圧縮」を選択することでロスレス（可逆）またはロッシー（非可逆）圧縮を行うことができます。 注: PDF圧縮機能はファイル一覧にPDFファイルがある場合にのみアクティブになります。
画像圧縮 ロッシー（非可逆）圧縮：解凍時に元のデータ損失が起こる形でPDFの画像データを圧縮します。データの損失の程度は圧縮品質の設定によって変わり、ファイルのサイズがより小さくなる可能性があります。圧縮品質は1~100の間で設定できます。
ロスレス（可逆）圧縮：元のデータが解凍中にデータ損失を発生しないようにPDF内の画像データを圧縮します。
保存場所 - ソースファイルと同じ - 変換するPDFが保存されているフォルダと同じフォルダを使います。
- 出力パスを選択 - 参照ボタンをクリックすると、出力先を選択できます
ファイル名に番号を挿入
- チェックが入っている：ファイル名の末尾に「_番号」が自動挿入されます（番号は1から順に振られます）
- チェックが入っていない：出力ファイル名は入力ファイル名と同じになり、出力パスが入力パスと同じ場合は既存のファイルが上書きされます。