Чтобы создать новый файл из выделенной части текущего файла, выделите отрезок и используйте меню Редактировать -> Скопировать в новый. Либо вы можете зажать клавишу Control и перетянуть выделенную область мышкой на пустое место в рабочем пространстве WavePad.