Un fichier de projet ne stocke que les chemins d'accès aux fichiers multimédia (dont les fichiers vidéo, audio et d'images), et non le contenu entier des fichiers. Lorsque vous chargez un fichier de projet, il tente de trouver et charger les fichiers multimédia avec ces chemins d'accès aux fichiers. Si un fichier multimédia a été déplacé ou supprimé, ou si le fichier de projet lui-même a été copié ou déplacé sur un autre ordinateur, VideoPad sera incapable de trouver les fichiers multimédia d'origine.

Pour sauvegarder un projet et tous ses fichiers multimédia ou pour déplacer un projet et tous ses fichiers multimédia vers un autre ordinateur, sélectionnez Fichier -> Sauvegarder le projet dans le dossier, ou Enregistrer le projet portable sous. Cette opération permet d'enregistrer un nouvel exemplaire du fichier de projet (.vpj) dans le dossier sélectionné et tous les fichiers multimédia utilisés dans le projet seront copiés dans le même dossier. Ce dossier tout entier peut ensuite être enregistré sur un support de sauvegarde ou copié ou déplacé vers un autre ordinateur.