WavePadではファイルのサンプルレートとチャンネル数を変換することができます。変換はファイル全体に行われます（ファイルの一部のみを変換することはできません）。
作業中のファイルのサンプルレートを変換するには、「編集」メニューから「サンプルレートを変換」をクリックし、新しいサンプルレートを選択します。サンプルレートは、毎秒6000から192000サンプルでなければなりません。一般的なサンプルレートはプルダウンメニューから選ぶことができます。
ファイルのチャンネル数を変更（ステレオからモノへ、またはその逆）するには、「編集」メニューから「チャンネルを変換」をクリックします。
サンプルレートの変換は、音声ファイルが電話で使われる場合（8000モノラル）や、インターネット送信用にファイルを圧縮する際（例：GSMの場合は11025または8000モノラル）などに主に行われます。サンプルレートの定義に関する詳細は良く使う音声用語をご覧ください。