フォルダやファイルを削除する：不要なフォルダやファイルの削除は、エクスプローラ（左画面）またはファイル一覧（右画面）で当該ファイルを選択し削除 ボタンををツールバーでクリック、または 削除を編集ニューから選んでクリックすることで行います。もしくは、単純にファイルを選択しキーボードの Deleteキーを押します。メモ：Express Zipのルート（最上階層）フォルダを削除することはできません。
フォルダを移動する： Express Zipエクスプローラ画面を使いフォルダを別の場所へ移動することができます。移動するファイルをクリックし移動先へドラッグしてください。メモ：ルート（最上階層）フォルダを移動することはできません。また、親フォルダをそのサブフォルダ内に移動することもできません。
フォルダの名前を変更する： Express Zipエクスプローラ画面を使いフォルダの名前を変更することができます。名前を変更するフォルダを選択し名前を変更を編集ニューから選びます。また、エクスプローラ画面でファイル名をクリックする形で変更することも可能です。
フォルダまたはファイルを挿入する：挿入したいフォルダやファイルがアーカイブ内にある場合はファイル/フォルダボタン（Ctrl + T/Ctrl + F）を使って挿入するファイルを選択するか、挿入するフォルダやファイルをエクスプローラからドラッグしメイン画面のファイル一覧（画面右側）にドロップします。ファイルやフォルダの挿入機能に対応しているアーカイブは以下の通りです：
圧縮レベル:
Express Zipは様々な圧縮レベルを使ってZipファイルを作成します。Zipファイルの圧縮率を変更するには、メニュータブで「ファイル」をクリックします。
プルダウンメニューから圧縮率を選択します。圧縮率は最速、速い、標準、小さい、最小から選択できます。
「最速」は圧縮にかかる時間は短いですが圧縮レベルは低くなります、「最小」は最も小さく圧縮されますが圧縮にかかる時間が長くなります。