WavePadではほぼ全てのフォーマットの保存時に、フォーマットの設定を確認するダイアログが表示されます。このダイアログは「ファイル」メニューから「名前を付けて保存」を選択し、出力フォーマットを指定すると表示されます。各設定ダイアログの内容は以下の通りです：

設定可能なフォーマットは以下の通りです：